小光是一个住在新奥地方的10岁女孩儿。今天是她以新人训练家的身份出去冒险旅行的值得纪念的日子。首先，为了得到最初的神奇宝贝，小光以隔壁城镇的神奇宝贝研究所为目标出发，然而却完全迷了路。 正巧这个时候，研究所里新人用神奇宝贝树苗龟、小火猴、圆企鹅开始打架引起了大骚乱！而且，神奇宝贝们从研究所逃了出来，这下子事态更加严重了！历经风波的小光的启程，究竟会变成怎么样呢！？

2006年，为配合NDS版（钻石、珍珠版）的上市，TV动画同步推出全新系列《神奇宝贝钻石&珍珠》（Pokémon Diamond & Pearl，简称DP）。对战开拓区篇结束后，小遥为了独自挑战城都地区的华丽大赛和小智告别，小胜回到了橙华道馆，小刚也回家去了。小智则受到了小茂的激励，独自带着皮卡丘和偷渡的长尾怪手前往神奥地区挑战联盟。 　　新登场的女主角小光，其蓝本取自电玩NDS版。为了成为顶尖协调训练家，小光从家乡双叶镇来到了位于真砂镇的山梨研究所领取最初的神奇宝贝。而同一时间，小智也抵达神奥地区，并在那里和小刚再度会合。机缘巧合，小光救了被火箭队抓走的皮卡丘，三人就一同结伴旅行，展开了新的旅程。 　　《神奇宝贝珍珠&钻石》每周四在日本首播。台湾也由中视进行转播，网络上能够找到前105集的国语配音。

讲述钻石边缘的珍珠Star Diamond 公司少东Pet（rome饰）准备为一条价值五亿名 　　为“阿朵列拉”的粉红钻石项链举办展示会，岂料还没展出，钻石项链就失窃。 “阿朵列拉”其实是某个王室失窃的珠宝之一，碍于面子所以没有对外公布，国际刑警正在追查此案，Mook（Susie饰）是Pet妈替儿子挑选的媳妇，真实身份其实是国际刑警，怀疑Pet妈在销赃，而且还找人偷走自己的钻石项链来骗保险金，而她哥哥Komkrit（Ta饰）就是保险公司少东，所以趁Pet 妈安排她去做Pet秘书的机会进去Star Diamond 公司查探。为了掩饰身份方便查探，Mook把自己扮成花痴接近Pet，Pet对妈妈硬塞来对象十分反感。

《精灵宝可梦》动画改编自同名游戏，讲述了立志成为宝可梦大师的小智和皮卡丘结伴旅行的故事。一路上，小智邂逅了不少同伴、劲敌、好友，和他们展开了一次又一次冒险。《精灵宝可梦 无印》共分为关都地区石英联盟、橘子群岛橘子联盟、城都地区城都联盟三个部分，因本作品无副标题，故又称为"无印"篇。

精灵宝可梦，简称宝可梦。 　　这个星球上有许多不可思议的不可思议生物。 　　空中、海中、森林中、街道中，你可以在这个世界的任何地方看到它们。 　　小智和皮卡丘继续着他们的冒险， 　　追寻着成为“宝可梦大师”的梦想。 　　与沿途的野生宝可梦相遇── 　　以及试图夺取皮卡丘的火箭队── 　　小智与皮卡丘在这样不变的冒险中过着每一日， 　　在某个森林中， 　　他们遇见了受伤的传说宝可梦·拉帝亚斯…！

精灵宝可梦，简称宝可梦。 　　这个星球上有许多不可思议的不可思议生物。 　　空中、海中、森林中、街道中，你可以在这个世界的任何地方看到它们。 　　小智和皮卡丘继续着他们的冒险， 　　追寻着成为“宝可梦大师”的梦想。 　　与沿途的野生宝可梦相遇── 　　以及试图夺取皮卡丘的火箭队── 　　小智与皮卡丘在这样不变的冒险中过着每一日， 　　在某个森林中， 　　他们遇见了受伤的传说宝可梦·拉帝亚斯…！

"小智与皮卡丘新的冒险开始了！新的冒险舞台是自然资源丰富的阿罗拉地区。在阿罗拉地区这个四处都是蔚蓝的天空和蓝色的大海的地方，等待着小智和皮卡丘的是？新的宝可梦，新的伙伴，以及新的经历……新的冒险旅程终于拉开了帷幕！去吧！全力！大冒险！！"

"小智与皮卡丘新的冒险开始了！新的冒险舞台是自然资源丰富的阿罗拉地区。在阿罗拉地区这个四处都是蔚蓝的天空和蓝色的大海的地方，等待着小智和皮卡丘的是？新的宝可梦，新的伙伴，以及新的经历……新的冒险旅程终于拉开了帷幕！去吧！全力！大冒险！！"

《精灵宝可梦XY&Z》是“XY”系列的第三季，故事紧随其后XY2之后，讲述击败了第七道馆的道馆训练家葛吉花后，小智一行人继续以收集齐八枚徽章为目标向映雪市进发。在旅途中，他们遇到了正体不明的绿色生物“小软”（基格尔德·核心）及为其目标而行动的神秘团体“闪焰队”。与此同时，小智和甲贺忍蛙之间发生的神秘联系也逐渐明朗……